（RE-14525・14526）マウス脳を対象としたシングルセル遺伝子発現解析業務【掲載期間：2026年11月2日～2026年11月24日】

公告期間： ～ ( )に付します。
1．競争入札に付する事項仕様書のとおり2．入札書等の提出場所等入札説明書等の交付場所及び入札書等の提出場所並びに問い合わせ先(ダイヤルイン)（メールアドレス省略）．(1)に記載の交付場所または電子メールにより交付する。
ただし、交付は土曜,日曜,祝日及び年末年始(12月29日～1月3日)を除く平日に行う。
電子メールでの交付希望の場合は、「 公告日,入札件名,当機構担当者名,貴社名,住所,担当者所属,氏名,電話,FAX,E-Mail 」を記載し、上記2．(1)のアドレスに送信。
交付の受付期限は の17:00までとする。
入札説明会の日時及び場所入札関係書類及び 技術審査資料 の提出期限開札の日時及び場所令和8年11月2日国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構財 務 部 長 服部 雅彦記(1)件 名 マウス脳を対象としたシングルセル遺伝子発現解析業務R8.11.2 R8.11.24 請負入 札 公 告下記のとおり 一般競争入札(4)履行場所 仕様書のとおり(1)(2)内 容(3)履行期限 令和9年2月27日E-mail：(2)令和8年11月24日 (火)〒263-8555 千葉県千葉市稲毛区穴川4丁目9番1号TEL （電話番号省略） FAX （電話番号省略）(4)令和8年11月25日(水) 17時00分(5)(3)実 施 し な い財務部 契約課 中林 美海令和8年12月8日(火) 10時00分本部(千葉地区) 入札事務室3．競争に参加する者に必要な資格当機構から指名停止措置を受けている期間中の者でないこと。
全省庁統一競争入札参加資格を有する者であること。
当機構が別に指定する誓約書に暴力団等に該当しない旨の誓約をできること。
4．入札保証金及び契約保証金 免除5．入札の無効入札参加に必要な資格のない者のした入札入札の条件に違反した者の入札6．契約書等作成の要否 要7．落札者の決定方法8．その他中に当機構ホームページにおいて掲載する。
以上 公告する。
(1)国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構 契約事務取扱細則第10条の規定に該当しない者であること。ただし、未成年者、被保佐人又は被補助人であって、契約締結のために必要な同意を得ている者についてはこの限りでない。
(2)落札決定に当っては、入札書に記載した金額に当該金額の10パーセントに相当する額を加算した金額(当該金額に1円未満の端数があるときは、その端数を切り捨てた金額とする)をもって落札価格とするので、入札者は、消費税に係る課税事業者であるか免税事業者であるかを問わず、見積もった金額の110分の100に相当する金額を入札書に記載すること。
(2)国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構 契約事務取扱細則第11条第1項の規定に該当しない者であること。
(3)(4)(5)(1)当機構の定める契約書(契約金額が500万円以上の場合)もしくは請書(契約金額が500万円未満の場合)を作成するものとする。
上記問い合わせ先宛てに質問書を提出すること。なお、質問に対する回答は令和8年11月16日 (月)その他、詳細については、入札説明書によるため、必ず上記2．(2)により、入札説明書の交付を受けること。
(1)この入札に参加を希望する者は、入札書の提出時に、当機構が別に指定する暴力団等に該当しない旨の誓約書を提出しなければならない。
(2)前項の誓約書を提出せず、又は虚偽の誓約をし、若しくは誓約書に反することとなったときは、当該者の入札を無効とするものとする。
(3)(4)本入札に関して質問がある場合には 令和8年11月12日 (木) 17:00までに(2)(1)技術審査に合格し、予定価格の制限の範囲内で、最低価格をもって有効な入札を行った入札者を落札者とする。 (最低価格落札方式)
仕 様 書1. 件名：マウス脳を対象としたシングルセル遺伝子発現解析業務2. 数量：24検体(各10,000細胞)3. 目的：本解析業務では、マウス脳を対象としたシングルセル遺伝子発現解析を実施することを目的とする。4. 納入期限：令和9年2月27日5. 納入場所： 千葉県千葉市稲毛区穴川4－9－1国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構量子医科学研究所 探索研究棟3階6. 仕様・性能：以下の仕様を満たすこと。・凍結組織から核を抽出するパイロット試験を実施する。核の計上、個数、夾雑物の混入の少ないものに対して、本試験を実施する。・(以降は本試験とする)凍結組織から核抽出を実施する。・10xGenomics社製Chromium Xを用い、10xGenomics社製GEM-X Universal 3’ Gene Expression v4 4-plex(PN-1000779)、GEM-X OCM 3' Chip Kit v4 4-plex 2 chips (PN-1000747)を使用し、エマルジョン形成およびcDNA合成を実施する。目標解析細胞数は1検体当たり10,000細胞とし、1検体あたり、OCMチップの2ウェルを使用する。・cDNAのサイズおよび濃度測定によるクオリティ評価を実施する。・クオリオティ評価を通過したサンプルに対して次世代シーケンサーのライブラリを調製する。・調製したライブラリをIllumina社NovaSeq X plusでRead 1 (28bp) + i7 index (8bp) + i5 index(8bp) + Read2 (90bp) で、1検体あたり合計200Mリードを目標としたシークエンシングを実施し、FASTQファイルを得る。・塩基配列データの QC を実施し、Index 情報にしたがって各サンプルデータを振り分ける(de-multiplexing)。・Cell Rangerパイプラインによる一次解析を実施する。・FASTQ形式データ、Cell Ranger 出力ファイル及び解析レポートを格納した記憶媒体を納品物とする。新鮮凍結マウス検体のシングルセル遺伝子発現解析を以下の専用試薬消耗品を用いて実施する。・GEM-X Universal 3 Gene Expression v4 4-plex, 16 samples, PN-1000779・GEM-X OCM 3' Chip Kit v4 4-plex, 2 chips, PN-1000747・Dual Index Kit TT Set A, 96 rxn, PN-1000215・Fastqファイル・Cell Rnager解析結果・情報シート(解析方法や使用試薬などをまとめたもの)納品方法は HDD または USB に格納し郵送する。その他の必要書類については発注者と受託者が協議し提出すること。7. 業務実施にあたり求める要件① 設備の要件(ア) 10x Genomics 社の優先サービスプロバイダー(10x Genomics Prefferred Service Provide)であり、トラブル発生時には、使用機器や試薬の供給元である 10xGenomics 社の正規のサポートが可能であること。(イ) トラブル時の迅速な対応を可能とするために、日本国内の同一事業所内に10x Genomics社のChromium Xが2台以上設置されていること。(ウ) トラブル時の迅速な対応を可能とするために、日本国内の同一事業所内に Illumina 社のNovaSeq X plusまたはNextSeq2000のいずれか有すること。② 業務従事者の要件(ア) 複数のマウス臓器を対象としたシングルセル解析について、受託者として各臓器の特性に応じた実験設計および条件最適化を実施できる体制を有し、当該臓器におけるシングルセル解析について、豊富な実績および経験を有していること。また、マウス脳組織におけるシングル核RNAシーケンス(snRNA-seq)における裸核抽出について、脳組織(大脳、小脳、海馬、線条体、脳幹等)の各部位に適した条件検討を実施した経験を有すること。(イ) 10x Genomics社製キットを用いたシングルセル遺伝子発現解析用ライブラリの作製について、安定した操作を担保する十分な経験(目安として 100 回以上の実施経験)を有する人員が実験を担当すること。(ウ) 前号の作業において、迅速かつ正確な作業を行うため、前号の条件を満たす人員が2名で同時に実験を実施する体制を有すること。(エ) 次世代シーケンサーから出力されるデータの解析を実施するために、コマンドラインによるデータ解析を実施できる人員が2名以上在籍していること。(オ) 日本国内に設置された Illumina 社製シーケンサーの操作経験を有する人員が2名以上在籍し、本委託業務におけるシークエンシング工程を実施可能な体制を有していること。(カ) シーケンスは適切な情報セキュリティ管理体制(ISO/IEC 27001やJIS Q 27001準拠など)を整えている施設で行うこと。(キ) 医学的知見を要する問い合わせに対応できるよう、医師または獣医師免許の資格を有する人員が在籍していること。(ク) 専門的な学術知識を要する問い合わせに対応できるよう、本委託業務を統括する責任者は以下の要件を満たすこと。①博士号または同等の研究実績を有する②シングルセル遺伝子発現解析を含む査読付き学術論文における相当数の著者経験(目安として10報以上の学術論文)を有すること③日本語でのサポートが可能であること。8. 検査条件： 納入時、当機構職員が、所定の要件を満たしていることを確認したことをもって検査合格とする。9.グリーン購入法の推進(1)本契約において、グリーン購入法(国等による環境物品等の調達の推進等に関する法律)に適用する環境物品(事務用品、OA機器等)の採用が可能な場合は、これを採用するものとする。(2)本仕様に定める提出図書(納入印刷物)については、グリーン購入法の基本方針に定める「紙類」の基準を満たしたものであること。10その他： 1)本仕様書に記載されている事項及び本仕様書に記載のない事項について疑義が生じた場合は、協議のうえ、その決定に従う。2)納入後1年以内に、当機構の責によらず装置に不具合が生じた場合、速やかに物品交 換や修理を無償で行うこと。(要求者)部課(室)名：脳機能イメージング研究センター氏名： 水間 広(担当者)氏名： 矢内 凜